آيت‌الله علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی ايران، محمدشريف ملک‌زاده را که از وی به عنوان يکی از اعضای "جريان انحرافی" نام برده می‌‌شود، عفو کرد.

آيت‌الله صادق لاريجانی، رئيس قوه قضائيه ايران از اینکه به محمدشريف ملک‌زاده، سمت تازه‌ای داده شده، انتقاد کرد.

روزنامه کيهان چاپ تهران از آيت‌الله محمود هاشمی شاهرودی، رئيس هيأت عالی حل اختلاف و تنظيم روابط قوای سه گانه به دليل اينکه محمدشريف ملک‌زاده را به عنوان مشاور اجرايی خود در بنياد فقه و معارف اهل بيت منصوب کرده، انتقاد کرد.

آیت‌الله محمود هاشمی شاهرودی، رئیس هیأت عالی حل اختلاف و تنظیم روابط قوای سه گانه، محمدشریف ملک‌زاده را به عنوان مشاور اجرایی خود در بنیاد فقه و معارف اهل بیت منصوب کرد.

علی‌اکبر جوانفکر، مشاور محمود احمدی‌نژاد، رئيس‌جمهوری ايران از ادامه بازداشت محمدشريف مک‌زاده، دبير شورای عالی ايرانيان خارج از کشور انتقاد کرده و گفته است هنوز مشخص نيست وی به چه «جرمی» در بازداشت به‌سر می‌برد.

روزنامه ابتکار در شماره يکشنبه پنجم تير ۱۳۹۰ خبر داده پس از بازداشت محمدشريف ملک‌زاده، معاون مستعفی وزارت امور خارجه و علی اصغر پرهيزکار، مديرعامل منطقه آزاد اروند، روز شنبه چهارم تير ۱۳۹۰ عليرضا مقيمی، مدير عامل منطقه آزاد ارس نيز بازداشت شد.